任何事情都是一分为二的，尤其在医学领域，治病的同时有可能会产生一些副作用。如药物的副作用，手术会留下疤痕等。相比之下，正畸治疗的副作用是很轻微的，而它的治疗效果却很显著，治疗作用是主要的。那么，正畸治疗会产生哪些影响呢？
(1)对牙髓的影响牙髓对正畸治疗的反应是微小的。在治疗的初期，牙髓内产生轻度的。暂时性的炎症反应，表现为患者在加力的头几天内有疼痛或不适的感觉，但这种轻度的牙髓炎还不足以引起牙髓的永久性损伤，不影响牙髓的活力，因而没有临床意义。
(2)对牙根的影响在正畸牙齿移动过程中，牙根表面也发生着吸收、增生这种重建活动。正畸治疗停止后，牙根凭着自身的修复能力而恢复正常。牙根结构的小量丧失是没有临床意义的，它不会影响牙齿的功能。如果牙根明显变短，则是有害的。正畸治疗中加力过大，会增加牙根吸收的危险性，正畸治疗的时间过长也能增加牙根的吸收量。
(3)对牙槽骨高度的影响牙槽骨高度与牙周的健康情况密切相关。戴用固定矫治器进行正畸治疗的患者，口腔卫生不容易保持，增加了患牙龈炎的机会，牙龈发炎会对牙槽骨高度有一定影响。做过正畸治疗的人，牙槽骨高度都会有少量的降低，在正畸治疗完成后，牙槽骨不会再继续发生吸收而降低，如果口腔卫生保持得好，牙槽骨会逐渐恢复正常。
(4)牙齿的松动度增加在正常情况下，牙齿有一定的可动度，以便能缓冲咀嚼压力，防止牙齿和牙周发生创伤。在正畸治疗时，牙齿的松动度有轻度增加，应该说是正常反应。正畸治疗使牙齿发生移动，不仅需要牙槽骨重建，而且还需要牙周膜自身的重建。牙周膜是把牙齿固定在牙槽骨上的一组纤维束，它重建时，先从骨和牙根表面分离，以后再重新附着。从X线片上观察，正畸治疗期间牙周膜腔是增宽的，这就意味着牙齿松动度的增加。正畸加力越大，牙齿松动度也越大。牙齿停止移动后，牙齿能够依靠自身修复来改善牙齿的松动度，而不会发生永久性损伤。所以，如果发现牙齿有太大的松动度，应暂时停止加力，让其恢复一段时间后再继续加力。
(5)疼痛因为牙周膜内的神经对外界压力非常敏感，所以正畸加力常常会引起患者的疼痛或不适。有时会持续3～4天，以后会逐渐减轻，直至消失，不必过分担心。正畸治疗的目的是既要达到治疗效果，又要使牙齿的移动尽量接近生理状态，虽然疗程长，但是对口腔组织的健康有好处。
另外还要提醒大家注意，正畸治疗必须由正畸专科医师进行，一知半解就盲目给患者矫治会造成一些意想不到的严重后果，在这方面是有很多沉痛教训的。