错颌畸形的危害性主要有两个方面：
【1】局部危害性：错颌畸形不但妨碍口腔颌面组织的正常发育，妨碍牙齿及牙周组织的健康，而且影响口腔功能及颜面的美观。
A：对颌面部发育的影响；有些错颌畸形发生以后，影响口腔及颌面软硬组织的正常发育，从而导致错颌畸形发展愈来愈严重，随着年龄的增长，颌面部的畸形愈来愈明显。
B：对口腔健康的影响；错颌患者有创伤性错颌而影响牙周组织、咀嚼肌及颞下颌关节的健康。拥挤的牙齿不易自洁，食物渣滞存在牙面上容易发生龋齿及牙周的炎症。
C：对口腔功能的影响；严重的错颌畸形，如严重的牙齿拥挤、开颌等畸形，影响发音，降低咀嚼功能。
D：对颜貌的影响；很多错颌畸形可造成颜面的畸形，影响美观。
【2】全身危害性：错颌严重时，咀嚼功能严重降低，引起消化不良及胃肠疾病，损害身体健康。有些错颌畸形由于妨碍了发音及外貌，甚至会影响职业的选择，也会造成心理负担。