有的小男孩生下来后会被发现阴茎较常人为小，他可能得的是一种叫做隐匿阴茎的先天畸形。
隐匿阴茎不是阴茎缺失，而是由于某种原因导致的阴茎内缩体内。临床上，隐匿阴茎也常常要注意和包茎的区别，这是两种完全不同的疾病，治疗方法也完全不同。
症状轻微的隐匿阴茎可以通过控制体重得到改善，有的未采取任何措施也可能自行改善。症状严重的恐怕只能通过手术矫正了，而且这种手术宜早不宜迟。如果手术时间过晚，可能因为阴茎长期内缩体内而导致阴茎的发育不良。而且长期的也对儿童的心理发育不利，容易导致其自卑心理。
隐匿阴茎的手术方法很多，可由手术医生灵活选择。重要一点是不要将隐匿阴茎和包茎弄混淆了。