2. 清洁头皮后，医师在后脑部进行局部麻醉注射，取得移植毛囊。
3.分离毛囊：
这一部份最关键也最辛苦，目前仍然以人工方式处理，皮辧取下以后，必须分离出一株株的毛囊单位。分离时间愈短毛囊移植后的存活率愈高，也需要精细的技巧，避免在分离时伤害到毛囊。用自动植发器来加速植发的速度，一直是植发学界期待的目标，可是机器固定的大小切割下去，常会伤到毛囊，更无法以自然的毛囊单位分割。因此为了得到较好的植发效果，目前还是采用人工分离毛囊的方式。
4.将毛囊植入头皮：
这又是很伤眼力的工作，医师必须先在前额秃发区作显微切口，再将毛发一株一株植入。目前还是以人工植入的存活率最高，密度最好，这需要相当的技术，种坏了就无法补救。
至于自动植发机，是很多植发医师的梦想，但是植发机在于做毛囊发株自动分割时，毛囊损伤率高达百分之卅左右，会造成毛发死亡，目前并不是可行的方式。所以目前植发还是要依靠人力密集的作业，医师还是无法脱离辛苦分毛种毛的恶梦，一次手术下来常常累得人仰马翻。
5.术后的照顾：
手术后可以马上回家，无需包扎，手术24小时后就可用凉开水冲洗头发，第4天就可以正常洗头，第10天后拆除后枕部的缝线。
手术后种入的头发暂时进入休止期，等待2～3月后会开始长出新头发，植入的头发有正常的生理特性，会永久生长、不受到男性荷尔蒙代谢的影响。成功的植发手术，毛囊的存活率可高于95%，因为对于雄性秃患者来说，每一根头发都很宝贵，禁不起随便耗损。如果单次的植发后，头发密度仍然不足，可在3～4个月后再次手术，通常1次的植发手术就可以改善秃发。