手术切除可以说是一种最彻底的祛痣方法，但是有一定的弊端。手术必然要对皮肤进行开刀，因而可能会留下疤痕。而且一些特殊的部位像口角周围，眼角，鼻梁等，手术后很容易造成畸形，因此，手术祛痣不是祛痣方法的最佳选择。
化学腐蚀的方法，这是一种以前常用的祛痣方法，但长期的临床实践证明，该方法不仅不能完全消除痣细胞，而且反复使用化学腐蚀剂容易恶性地刺激黑色素细胞，可能还会引起皮肤癌变。
激光治疗是运用激光对局部组织进行扫描并切割，但在扫描的过程中可能会漏掉个别痣，这样可能引起痣的复发。
冷冻是当前应用人数较多的方法，其优点是几乎看不见疤痕，但缺点同样存在，就是一般需要很多次治疗后才能根除病变。