世上没有绝对完美的东西，
抽脂应用不当也会发生严重的不良后果。但在一些开展该业务的院或者机构的宣传推广中，为了招徕更多的顾客，往往只突出上述有利的方面，而对其它方面避而不谈或敷衍略过，宣称一次即可达到永久的理想效果，为此不惜以牺牲患者的健康为代价，违反科学原则，一次注射大量的脂肪，导致了大量的不良后果。
从人体抽出的脂肪组织虽经过清洗、处理和筛选后才注入乳房，但由于脂肪组织没有血液循环，如果不遵守正确的操作规范，脂肪的用量过多或注射过于集中，大量脂肪堆积在一起，会因供血不足导致脂肪坏死、溶解、吸收，极易引发感染，出现疼痛和产生囊肿、纤维化或钙化、乳房变形、脂肪坏死等后遗症。虽然由此而致癌的几率不高，但坏死的脂肪如形成硬块及纤维化，将影响乳房X光摄影检查的结果，延误对乳癌的诊断或者造成误诊。
上面提到的不良后果，主要是术者对于颗粒脂肪移植的成活机理的认识欠缺、违反操作常规和缺乏经验造成的。外科专家认为，对比早期的抽脂，现在技术较为成熟，不容易失败。相关的依据是，以少量注射的方式进行多次施术，广泛而均匀地注射，增加移植的脂肪细胞与周围组织接触面积，可以明显提高脂肪移植的存活率。此外，现在可通过筛选，把活的脂肪“洗”出来，并通过加入碱性成纤维细胞生长因子（bFGF）等措施，也有利于解决脂肪成活的问题。
另外，根据一些专家的介绍，抽脂成败的另一个关键因素就在于自体脂肪的提纯，由于过程中无法检测脂肪的纯度，因此更多的是主治医生以自己的经验、技术去保证提纯的效果，而目前，即使是北京这样的大城市，也只有10家左右的医疗机构可操作此技术。
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